瑞巌寺隧道（ずいがんじ）は大分県玖珠郡九重町にあった隧道。

江戸時代の1855（安政5）年に竣工した小さな隧道を前身とし、大正から昭和初期頃に拡幅され、延長約18ｍ、幅員約3ｍの素掘り隧道として使用されていた。

道路がカーブする地点にありため見通しが悪く、1979（昭和54）年に開削撤去された。

跡地は道路となっているため遺構は見られないが、安政時代の寄付者を記した石板、昭和54年の取り壊し記念の石板、および石碑が残されている。